In een protocol vermeld je het geobserveerde gedrag. In een protocol valt af te lezen hoe vaak en hoe lang een dier een gedragselement uitvoert. Een protocol is dus een handig hulpmiddel om gedragselementen in kaart te brengen.

Een voobeeld van een protocol:

Je bekijkt het gedrag van het dier in stapjes van 5 sec. Zoals je ziet in de linker kolom. Je vult dus voor elke 5 sec in welke gedragselementen je observeert. Deze gedragselementen vul je in als afkortingen die je in het ethogram heb ingevuld. Er kunnen meer dan een gedragselement per vakje worden ingevuld. Dit doe je voor elke minuut zolang als je aan het observeren bent.